Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFIAQ12857 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
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