Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CGNL1Q0VF96 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CGNL1Q0VF96 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms