Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBRQ0VD83 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms