Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms