Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms