Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TGM3Q08188 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms