Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EGR3Q06889 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms