Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABPAQ06546 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABPAQ06546 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms