Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PTPN11Q06124 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTPN11Q06124 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms