Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHRNB3Q05901 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms