Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ERCC6Q03468 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC31.82■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC31.79■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ERCC6Q03468 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms