Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNA1DQ01668 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms