Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM3AP98173 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms