Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAE1P78406 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAE1P78406 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAE1P78406 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAE1P78406 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAE1P78406 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAE1P78406 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAE1P78406 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAE1P78406 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAE1P78406 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAE1P78406 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAE1P78406 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAE1P78406 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAE1P78406 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAE1P78406 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAE1P78406 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAE1P78406 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAE1P78406 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAE1P78406 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RAE1P78406 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAE1P78406 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAE1P78406 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAE1P78406 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAE1P78406 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAE1P78406 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAE1P78406 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAE1P78406 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAE1P78406 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAE1P78406 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAE1P78406 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAE1P78406 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAE1P78406 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAE1P78406 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAE1P78406 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAE1P78406 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAE1P78406 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAE1P78406 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAE1P78406 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAE1P78406 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAE1P78406 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAE1P78406 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAE1P78406 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAE1P78406 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAE1P78406 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAE1P78406 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAE1P78406 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAE1P78406 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAE1P78406 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAE1P78406 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAE1P78406 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAE1P78406 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAE1P78406 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAE1P78406 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAE1P78406 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAE1P78406 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAE1P78406 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAE1P78406 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAE1P78406 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAE1P78406 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAE1P78406 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAE1P78406 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAE1P78406 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAE1P78406 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAE1P78406 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAE1P78406 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAE1P78406 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAE1P78406 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms