Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH3BP2P78314 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SH3BP2P78314 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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