Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GNB1P62873 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GNB1P62873 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB1P62873 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB1P62873 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB1P62873 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB1P62873 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB1P62873 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB1P62873 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB1P62873 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB1P62873 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB1P62873 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB1P62873 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB1P62873 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB1P62873 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB1P62873 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB1P62873 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB1P62873 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB1P62873 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB1P62873 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GNB1P62873 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GNB1P62873 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GNB1P62873 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GNB1P62873 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GNB1P62873 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GNB1P62873 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GNB1P62873 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GNB1P62873 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GNB1P62873 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GNB1P62873 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GNB1P62873 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GNB1P62873 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GNB1P62873 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GNB1P62873 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GNB1P62873 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms