Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMA6P60900 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PSMA6P60900 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms