Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACTBP60709 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTBP60709 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTBP60709 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTBP60709 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms