Protein–RNA interactions for Protein: P60510

PPP4C, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4CP60510 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4CP60510 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4CP60510 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms