Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EEFSECP57772 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EEFSECP57772 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms