Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SH3BGRP55822 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms