Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLTPP55058 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLTPP55058 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLTPP55058 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLTPP55058 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLTPP55058 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLTPP55058 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLTPP55058 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLTPP55058 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLTPP55058 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLTPP55058 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLTPP55058 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLTPP55058 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLTPP55058 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLTPP55058 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLTPP55058 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLTPP55058 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLTPP55058 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLTPP55058 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLTPP55058 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLTPP55058 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PLTPP55058 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLTPP55058 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLTPP55058 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLTPP55058 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLTPP55058 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLTPP55058 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLTPP55058 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLTPP55058 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLTPP55058 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLTPP55058 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLTPP55058 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLTPP55058 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PLTPP55058 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PLTPP55058 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLTPP55058 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLTPP55058 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLTPP55058 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLTPP55058 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLTPP55058 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLTPP55058 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLTPP55058 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLTPP55058 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLTPP55058 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLTPP55058 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLTPP55058 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PLTPP55058 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLTPP55058 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PLTPP55058 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLTPP55058 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLTPP55058 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLTPP55058 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLTPP55058 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLTPP55058 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLTPP55058 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLTPP55058 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLTPP55058 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLTPP55058 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLTPP55058 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLTPP55058 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLTPP55058 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLTPP55058 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PLTPP55058 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLTPP55058 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLTPP55058 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLTPP55058 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLTPP55058 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PLTPP55058 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLTPP55058 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLTPP55058 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLTPP55058 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLTPP55058 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLTPP55058 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLTPP55058 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLTPP55058 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLTPP55058 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PLTPP55058 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLTPP55058 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLTPP55058 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLTPP55058 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLTPP55058 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLTPP55058 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLTPP55058 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLTPP55058 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLTPP55058 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PLTPP55058 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PLTPP55058 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PLTPP55058 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PLTPP55058 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PLTPP55058 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms