Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP98P52948 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP98P52948 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP98P52948 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP98P52948 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP98P52948 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP98P52948 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP98P52948 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP98P52948 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP98P52948 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP98P52948 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP98P52948 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP98P52948 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP98P52948 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP98P52948 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP98P52948 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP98P52948 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP98P52948 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP98P52948 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP98P52948 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP98P52948 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP98P52948 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP98P52948 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP98P52948 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP98P52948 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP98P52948 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP98P52948 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP98P52948 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP98P52948 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP98P52948 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP98P52948 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP98P52948 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP98P52948 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP98P52948 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP98P52948 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP98P52948 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP98P52948 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP98P52948 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP98P52948 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP98P52948 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP98P52948 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP98P52948 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP98P52948 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP98P52948 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP98P52948 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP98P52948 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP98P52948 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP98P52948 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP98P52948 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP98P52948 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP98P52948 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP98P52948 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP98P52948 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP98P52948 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP98P52948 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP98P52948 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP98P52948 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP98P52948 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP98P52948 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP98P52948 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP98P52948 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP98P52948 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP98P52948 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP98P52948 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP98P52948 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP98P52948 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP98P52948 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP98P52948 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms