Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPC3P51654 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPC3P51654 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPC3P51654 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPC3P51654 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GPC3P51654 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GPC3P51654 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC3P51654 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC3P51654 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC3P51654 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC3P51654 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC3P51654 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC3P51654 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC3P51654 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC3P51654 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC3P51654 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC3P51654 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC3P51654 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC3P51654 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC3P51654 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC3P51654 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC3P51654 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC3P51654 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC3P51654 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC3P51654 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC3P51654 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC3P51654 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC3P51654 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC3P51654 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC3P51654 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC3P51654 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC3P51654 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC3P51654 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GPC3P51654 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC3P51654 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC3P51654 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC3P51654 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC3P51654 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC3P51654 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC3P51654 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC3P51654 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC3P51654 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC3P51654 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC3P51654 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC3P51654 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC3P51654 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC3P51654 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC3P51654 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC3P51654 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC3P51654 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC3P51654 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC3P51654 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC3P51654 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GPC3P51654 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPC3P51654 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPC3P51654 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPC3P51654 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPC3P51654 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPC3P51654 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPC3P51654 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPC3P51654 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPC3P51654 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPC3P51654 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms