Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BCAMP50895 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAMP50895 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAMP50895 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAMP50895 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAMP50895 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAMP50895 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAMP50895 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAMP50895 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAMP50895 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAMP50895 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAMP50895 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAMP50895 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAMP50895 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAMP50895 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAMP50895 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAMP50895 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAMP50895 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAMP50895 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAMP50895 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAMP50895 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAMP50895 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAMP50895 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAMP50895 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BCAMP50895 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAMP50895 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAMP50895 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAMP50895 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAMP50895 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAMP50895 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAMP50895 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAMP50895 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAMP50895 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAMP50895 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAMP50895 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAMP50895 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAMP50895 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAMP50895 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAMP50895 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAMP50895 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAMP50895 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAMP50895 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAMP50895 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAMP50895 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAMP50895 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BCAMP50895 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAMP50895 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAMP50895 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAMP50895 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAMP50895 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAMP50895 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAMP50895 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAMP50895 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAMP50895 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAMP50895 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAMP50895 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAMP50895 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAMP50895 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAMP50895 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAMP50895 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAMP50895 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAMP50895 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAMP50895 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAMP50895 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAMP50895 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAMP50895 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAMP50895 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAMP50895 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAMP50895 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAMP50895 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAMP50895 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAMP50895 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BCAMP50895 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCAMP50895 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCAMP50895 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCAMP50895 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCAMP50895 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms