Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNNI2P48788 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms