Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms