Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CAPZBP47756 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CAPZBP47756 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms