Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FDFT1P37268 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms