Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM23P36406 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms