Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PCGF2P35227 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms