Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MARCKSP29966 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MARCKSP29966 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MARCKSP29966 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MARCKSP29966 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MARCKSP29966 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MARCKSP29966 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MARCKSP29966 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MARCKSP29966 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MARCKSP29966 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.33■■□□□ 1
MARCKSP29966 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MARCKSP29966 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCKSP29966 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCKSP29966 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCKSP29966 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCKSP29966 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MARCKSP29966 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCKSP29966 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCKSP29966 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCKSP29966 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCKSP29966 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCKSP29966 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCKSP29966 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCKSP29966 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCKSP29966 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCKSP29966 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MARCKSP29966 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCKSP29966 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCKSP29966 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCKSP29966 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCKSP29966 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCKSP29966 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MARCKSP29966 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCKSP29966 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MARCKSP29966 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms