Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTSSP25774 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTSSP25774 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTSSP25774 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSSP25774 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSSP25774 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSSP25774 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSSP25774 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTSSP25774 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms