Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTAFRP25105 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms