Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALB2P22676 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALB2P22676 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALB2P22676 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CALB2P22676 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALB2P22676 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALB2P22676 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALB2P22676 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALB2P22676 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALB2P22676 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALB2P22676 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALB2P22676 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALB2P22676 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALB2P22676 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALB2P22676 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALB2P22676 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALB2P22676 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALB2P22676 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALB2P22676 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALB2P22676 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALB2P22676 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALB2P22676 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CALB2P22676 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALB2P22676 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALB2P22676 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALB2P22676 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALB2P22676 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALB2P22676 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALB2P22676 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALB2P22676 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALB2P22676 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALB2P22676 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALB2P22676 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALB2P22676 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CALB2P22676 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALB2P22676 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALB2P22676 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALB2P22676 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALB2P22676 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALB2P22676 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALB2P22676 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALB2P22676 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALB2P22676 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALB2P22676 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALB2P22676 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALB2P22676 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALB2P22676 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALB2P22676 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CALB2P22676 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CALB2P22676 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CALB2P22676 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CALB2P22676 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CALB2P22676 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CALB2P22676 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CALB2P22676 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALB2P22676 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALB2P22676 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALB2P22676 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CALB2P22676 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALB2P22676 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALB2P22676 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALB2P22676 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALB2P22676 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALB2P22676 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALB2P22676 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALB2P22676 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALB2P22676 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CALB2P22676 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms