Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERBB3P21860 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERBB3P21860 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERBB3P21860 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERBB3P21860 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERBB3P21860 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERBB3P21860 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERBB3P21860 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERBB3P21860 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERBB3P21860 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERBB3P21860 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERBB3P21860 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms