Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
C4BPBP20851 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4BPBP20851 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms