Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CXCL2P19875 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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