Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TSPAN8P19075 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms