Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CREB1P16220 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CREB1P16220 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CREB1P16220 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CREB1P16220 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CREB1P16220 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB1P16220 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB1P16220 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB1P16220 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB1P16220 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB1P16220 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB1P16220 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB1P16220 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB1P16220 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB1P16220 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB1P16220 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB1P16220 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB1P16220 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB1P16220 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB1P16220 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB1P16220 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB1P16220 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB1P16220 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB1P16220 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB1P16220 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB1P16220 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB1P16220 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB1P16220 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB1P16220 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB1P16220 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB1P16220 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB1P16220 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB1P16220 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CREB1P16220 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CREB1P16220 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms