Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GABRA1P14867 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GABRA1P14867 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms