Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms