Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP3P12645 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP3P12645 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP3P12645 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP3P12645 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP3P12645 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP3P12645 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP3P12645 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP3P12645 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP3P12645 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP3P12645 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP3P12645 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP3P12645 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP3P12645 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP3P12645 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP3P12645 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP3P12645 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP3P12645 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP3P12645 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP3P12645 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP3P12645 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BMP3P12645 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP3P12645 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP3P12645 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP3P12645 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP3P12645 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP3P12645 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP3P12645 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP3P12645 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP3P12645 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP3P12645 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP3P12645 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP3P12645 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP3P12645 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP3P12645 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP3P12645 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP3P12645 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP3P12645 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP3P12645 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP3P12645 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP3P12645 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP3P12645 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP3P12645 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP3P12645 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BMP3P12645 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BMP3P12645 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BMP3P12645 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BMP3P12645 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BMP3P12645 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BMP3P12645 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BMP3P12645 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BMP3P12645 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BMP3P12645 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BMP3P12645 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BMP3P12645 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BMP3P12645 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BMP3P12645 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BMP3P12645 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BMP3P12645 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BMP3P12645 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BMP3P12645 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
BMP3P12645 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP3P12645 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP3P12645 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP3P12645 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP3P12645 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP3P12645 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP3P12645 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP3P12645 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP3P12645 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP3P12645 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP3P12645 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP3P12645 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP3P12645 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP3P12645 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP3P12645 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP3P12645 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP3P12645 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP3P12645 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP3P12645 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP3P12645 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP3P12645 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP3P12645 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP3P12645 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BMP3P12645 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms