Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEFHP12036 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEFHP12036 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NEFHP12036 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NEFHP12036 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NEFHP12036 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEFHP12036 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEFHP12036 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEFHP12036 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEFHP12036 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEFHP12036 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NEFHP12036 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEFHP12036 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NEFHP12036 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms