Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLI3P10071 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLI3P10071 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLI3P10071 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLI3P10071 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLI3P10071 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GLI3P10071 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLI3P10071 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLI3P10071 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLI3P10071 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLI3P10071 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GLI3P10071 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GLI3P10071 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GLI3P10071 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GLI3P10071 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GLI3P10071 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI3P10071 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI3P10071 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI3P10071 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI3P10071 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI3P10071 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI3P10071 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI3P10071 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI3P10071 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI3P10071 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI3P10071 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI3P10071 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI3P10071 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI3P10071 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI3P10071 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI3P10071 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI3P10071 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI3P10071 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI3P10071 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI3P10071 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI3P10071 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI3P10071 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI3P10071 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI3P10071 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLI3P10071 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLI3P10071 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLI3P10071 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GLI3P10071 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLI3P10071 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLI3P10071 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLI3P10071 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLI3P10071 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLI3P10071 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLI3P10071 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLI3P10071 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLI3P10071 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLI3P10071 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GLI3P10071 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GLI3P10071 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI3P10071 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI3P10071 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI3P10071 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI3P10071 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI3P10071 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI3P10071 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI3P10071 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI3P10071 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI3P10071 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI3P10071 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI3P10071 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI3P10071 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI3P10071 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI3P10071 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI3P10071 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI3P10071 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI3P10071 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI3P10071 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI3P10071 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI3P10071 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI3P10071 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI3P10071 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI3P10071 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI3P10071 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI3P10071 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI3P10071 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI3P10071 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI3P10071 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLI3P10071 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLI3P10071 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLI3P10071 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLI3P10071 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLI3P10071 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLI3P10071 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GLI3P10071 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLI3P10071 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GLI3P10071 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLI3P10071 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLI3P10071 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GLI3P10071 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GLI3P10071 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GLI3P10071 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLI3P10071 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GLI3P10071 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLI3P10071 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLI3P10071 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms