Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM225BP0DP42 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms