Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC192P0DO97 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms