Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAPPC2P0DI81 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAPPC2P0DI81 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms