Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX7O95931 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX7O95931 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX7O95931 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX7O95931 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX7O95931 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX7O95931 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX7O95931 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX7O95931 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX7O95931 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX7O95931 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX7O95931 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX7O95931 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX7O95931 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX7O95931 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX7O95931 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX7O95931 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX7O95931 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX7O95931 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX7O95931 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX7O95931 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX7O95931 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX7O95931 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBX7O95931 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CBX7O95931 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CBX7O95931 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CBX7O95931 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CBX7O95931 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX7O95931 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX7O95931 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX7O95931 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX7O95931 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX7O95931 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX7O95931 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX7O95931 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX7O95931 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX7O95931 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX7O95931 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX7O95931 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX7O95931 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX7O95931 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX7O95931 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX7O95931 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX7O95931 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX7O95931 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX7O95931 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX7O95931 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX7O95931 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX7O95931 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX7O95931 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX7O95931 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX7O95931 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX7O95931 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CBX7O95931 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CBX7O95931 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms