Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCELO95171 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCELO95171 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCELO95171 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SCELO95171 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCELO95171 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCELO95171 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCELO95171 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCELO95171 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCELO95171 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCELO95171 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCELO95171 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCELO95171 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCELO95171 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCELO95171 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCELO95171 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCELO95171 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCELO95171 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCELO95171 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCELO95171 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SCELO95171 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCELO95171 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCELO95171 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCELO95171 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCELO95171 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCELO95171 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SCELO95171 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCELO95171 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCELO95171 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCELO95171 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCELO95171 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCELO95171 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCELO95171 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCELO95171 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCELO95171 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCELO95171 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCELO95171 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCELO95171 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCELO95171 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCELO95171 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCELO95171 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCELO95171 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCELO95171 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCELO95171 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCELO95171 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCELO95171 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCELO95171 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCELO95171 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCELO95171 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCELO95171 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCELO95171 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCELO95171 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SCELO95171 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCELO95171 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCELO95171 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCELO95171 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCELO95171 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCELO95171 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCELO95171 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCELO95171 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCELO95171 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCELO95171 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCELO95171 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCELO95171 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCELO95171 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCELO95171 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCELO95171 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCELO95171 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCELO95171 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCELO95171 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCELO95171 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCELO95171 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms